Komik Sunan Kalijaga mengisahkan perjalanan hidup salah satu tokoh Wali Songo yang berperan besar dalam penyebaran Islam di tanah Jawa, yaitu Sunan Kalijaga. Diceritakan bahwa sebelum menjadi ulama yang dihormati, beliau dikenal dengan nama Raden Said, seorang pemuda bangsawan yang hidup pada masa Kerajaan Demak. Pada masa mudanya, Raden Said sempat dikenal sebagai sosok pemberontak yang merampok orang-orang kaya demi membantu rakyat miskin. Namun, pertemuannya dengan Sunan Bonang menjadi titik balik kehidupannya. Melalui bimbingan spiritual dan ujian kesabaran, Raden Said mengalami perubahan batin yang mendalam hingga akhirnya menjadi seorang wali yang bijaksana. Komik ini menggambarkan strategi dakwah Sunan Kalijaga yang unik dan penuh kearifan lokal. Ia menyebarkan ajaran Islam melalui pendekatan budaya, seperti seni wayang, gamelan, dan tembang Jawa, sehingga ajarannya mudah diterima masyarakat tanpa paksaan. Nilai toleransi, kebijaksanaan, kesederhanaan, serta cinta damai menjadi pesan utama yang disampaikan dalam cerita.